A leggyakoribb problémák közé tartozik a vízhozam csökkenése, a szennyeződések megjelenése a vízben, illetve a szivattyú meghibásodása. Ezek a problémák általában karbantartási hiányosságokra vagy a kút helytelen tervezésére vezethetők vissza. Rendszeres kútkarbantartás és időszakos ellenőrzések segítenek megelőzni ezeket a problémákat.